为了有效预防及时控制和消除突发公共卫生事件的危害，保障公众身体健康与生命安全，维护正常的社会秩序，必须要有一套完整、科学、有力的预警和应急机制。能够在最短的时间内配齐人员、物资，将危害减少到最低程度。因此必须做到平时库存物资的充足完好，在应急处理突发公共卫生事件时才能使后勤保障和物资供应准时到位。
1 药品、器械的储备
突发公共卫生事件具有突发性。突如其来，不易预测，他的发生有很大的偶然性。平时，人们对他的潜在威胁感觉不到，因此易产生麻痹思想。在卫生防疫部门后勤物资的准备方面存在着投入不到，保管不当的问题。因为这方面的投入得不到局部的利益，而且还要消耗大量的资源。当突如其来的公共卫生事件发生时，就会感到束手无策，手忙脚乱，到处采购物资，延误公共卫生事件的处理。如在1996年我们地区遭遇到了30年未遇的洪涝灾害，有六个县成为了重灾区，有六个县不同程度的受灾。房屋被冲，牲畜死亡，有的地方居民转移到高处，使人口密度增大，垃圾、粪便和污水得不到及时处理，饮水设施遭到破坏。一旦引起介水传染病的流行，将会很快传播漫延。为了防止介水传染病的发生和流行，在政府和卫生行政部门的领导下，在灾害发生的6个小时后，迅速组成了医疗防疫小分队，深入灾区第一线防病灭病，开展卫生宣传工作。但是令人遗憾的是，当医疗防疫小分队组成后，消杀药品、消杀器械严重缺损。由于平时思想麻痹，消杀药品、器械就没有固定的仓库、固定的人员保管，这里放一部分，那里放一部分。仅存的有效的漂白精粉只有12桶(50kg／桶)，桶的外包装有的已严重破损，不能运输只好又买来编织袋重新装起。另外还有几箱六十年代的塑料瓶装的漂白粉精片，有效氯成份已大大降低，塑料瓶用手一捏就破损，以及七十年代初的来苏水。由于洪灾公路被冲，外界的物资不能马上运到。在这种危急情况下真是束手无策，毫无办法。如果在乎时能够做好后勤物资的储备，做好防大疫、抗大疫和应对各种困难局面和复杂局面的准备，对突如其来的公共卫生事件，就能使危害降低到到小程度。由于50年来卫生防疫部门贯彻“预防为主”的方针，已建立起了许多应对具体突发卫生事件的应急机制，也就是说对于可预见的突发性卫生事件是可以预防的。因此我们地区在大灾之年没有大的传染病发生。由于这次灾害的经验教训，新建了通风、防潮的仓库，固定了转人负责，购进了一定量的消杀药品，在“非典”到来时我们库存的消杀药品没有出现断档，及时做好了预防消毒工作。
建设良好的通风、防潮仓库，做好库存药品、器械的储备，专人保管，才能保证应急处理的及时。库存药品尤其是消毒药品存放周期短，易潮湿，在采购时应注意长效的多采购一些，短效的少采购一些，存放在通风良好不易潮湿的地方，妥善保管。及时核对库存，对过期的药品急时清理，急时补充。开拓货源确保库存药品、器械的质量。做到使储备的药品、器械，在处理突发公共卫生事件中不断档。保管人员应了解每种药品的性能、使用方法，熟悉每种药品、器械的存放地，在应急处理时能够及时准确把所需各种物准备齐全。
2 个人防护用品的储备
卫生防疫人员是处理突发公共卫生事件的主力是站在疫情最前沿的人，在突发事件的预防控制(查找传染源、传播途径、易感人群)、救治病人、终末消毒的过程中，接触传染病病原体和有毒有害物质的机会最多，风险最大，因此对卫生防疫人员的个人防护尤其重要，必须配备全套的个人防护用品，以保护卫生防疫人员的生命健康安全。由于思想麻痹，不重视卫生防疫人员个人防护，使个人防护用品的库存几乎没有。在突如其来的“非典”到来时，我们的卫生防疫人员只有一件白大衣，和库存的几双胶鞋，几套六十年代遗留下来的隔离衣。因此在库存物资中应该加强个人防护用品的储备，以保证卫生防疫人员在处理各种突发性公共卫生事件中个人生命健康安全，避免卫生防疫人员的感染，避免卫生人员成为传染源，也必须避免医院成为疫源地。做好个人防护是保护卫生防疫人员的健康安全的保障。在平时就应该对在进行流行病学调查和终末消毒处理的卫生防疫人员的个人设备准备齐全，使每一位参加流行病学调查和终末消毒处理的卫生防疫人员都有2-3套个人防护设施，及隔离衣、帽、口罩、手套、胶鞋、眼镜。保证他们在：正作中不受伤害，身体健康安全。
3 建立医疗药品、设备信息平台
当今的世界是信息化的世界。充分利用网络传递信息的速度优势、空间优势、双向交流优势及其信息交流的及时性、广泛性和新颖性建立一个信息平台，发布在突发公共卫生事件中应用到的治疗、预防、消杀等药品、设备，医疗卫生防疫人员防护用品。一但有突发性公共卫生事件发生，能在最短的时间内通过网络查询到所需用的药品和设备，增强快速反应的能力。也可以省为单位建立突发性公共卫生事件大型物资储备库，以地市为单位建立小型物资储备库。当突发性公共卫生事件发生时，能够迅速调用储备库的物资，提高应急反应的速度，使危害降低到最小程度。