建立应急反应组织是应急预案的一个重要目的，任何救援队都是救援力量的组成部分，任何救援力量都不能包办所有的救援任务，完整的救援体系是由分层次，分地区，具有一定地方特色和行业特点的救援力量组成。根据企业、行业、地区和本城市的特点，组建不同层次的救援系统，由政府牵头，本着“一队多用，专兼结合，警民结合，平战结合”的原则，整合各种救援力量，协调各组织的日常工作和救援工作。在紧急时刻，要求应急反应组织能在最短时间内部署完毕。为此，要提出以下问题：
(1)紧急情况发生时由谁来指挥操作？
(2)当更多的企业和企业外反应人员到达事故现场时，指挥结构如何变化？
(3)如果紧急状况恶化时，需要更多的资源和出现更多的受影响点（包括企业内企业外），指挥结构如何变化？
(4)谁来决定分配减缓事故的资源？
(5)谁应该在紧急时与谁保持通信联络？
(6)哪些应急功能（如消防、工程、医疗等）应该行动，什么时候？如何行动？
(7)哪些人负责专项应急反应功能？
(8)各种指挥岗位应位于哪里？
(9)谁来决定采取何种行动以保护外部人群？
（10）所有应急功能协调员互相之间如何联络？
(11)谁提供技术建议来开始反应行动？
（12）谁来决定什么时候应急结束，批准重新进人危险区？
这些问题可通过建立一个完整的反应组织指挥结构和职责表格来回答。此外，最初反应组织结构也要确定出来，以便在当班时立即启动应急反应。
（1）最初反应组织
一天中的每时每刻都可能发生事故，应急反应组织必须保证在任何时候接到报警后立即行动。及时正确的最初应急反应行动可以极大地降低事故的后果。最初协调应急行动的责任一般由当班负责人负责，直到有更高级的人员来替代，例如企业负责人到达事故现场后。最初阶段，当班负责人要临时担任企业应急总指挥的功能，因此要根据事故严重程度来评价应急行动级别，通知相关人员、部门和机构参加应急行动。
与此类似，企业其他人员将分别担任最初反应组织的其他重要功能，直到规定人员到达事故现场替代他们。这些职责分配要预先明确下来，而不是等到紧急时刻再开始。
（2）全体应急反应组织
不是所有的事故都严重到要求动员全体反应组织。可是在全体应急状态下，企业应急总指挥员应该启动所有应急预案要求的行动，包括启动全体应急反应组织。要求所有职责要配备足够人员，以便保证每个岗位都有人员。每个岗位可能有多个任务，所以主要人员或代理人可在全体应急反应组织启动后任何时候能承担职责。
负责不同功能的人员应为企业应急总指挥提供建议并执行企业应急总指挥做出的决定。这些人员主要包括负责生产、工程、技术、人事、医疗、交通、安全、环保和保卫的高级管理人员。他们将根据具体情况决定该采取哪种反应行动，如关闭企业，灭火，疏散业人员或群众，进行应急修复工作，安排设备物资供应，进行应急检测和协调企业与当地公安消防和其他机构的行动。
（3）企业应急总指挥
在任何时候企业必须只有一个人负责指挥整个应急反应组织。他的主要职责包括对所有保护公众、员工、环境和企业设施的行动，事故的救援和控制行动的指挥。企业应急总指挥的职责为：
a．分析紧急状态和确定相应报警级别，这些分析要根据相关危险类型（例如，火灾、爆炸、泄漏）、它的潜在后果（包括企业内外）、现有资源和控制紧急情况的行动类型来做出；
b．指挥、协调应急反应行动；
c．与企业外应急反应人员、部门、组织和机构进行联络；
d．直接监察应急操作人员的行动；
e．保证现场和企业外人员安全；
f．协调后勤方面以支援反应组织。
在执行这些任务时，企业应急总指挥会得到从事专项任务的应急反应人员的帮助。企业应急总指挥不能把下列任务交给工作人员执行：
a．应急反应组织的启动；
b．应急评估，包括升高或降低应急警报级别；
c．通报外部机构；
d．决定请求外部援助；
e．决定从企业或其他部分撤离；
f．决定企业外影响区域的安全性（例如，在毒气泄漏时建议疏散或安全避难）。
在许多情况下，企业应急总指挥的职能可由企业总负责人担任，在紧急情况下，企业应急总指挥的主要功能是总体指挥，大量实际反应和协调任务主要由负责生产或安全的副总指挥执行，因为他更具有技术、经验和更熟悉应急反应操作。与所有其他应急职位一样，企业应急总指挥是分配给企业组织内的工作职位，而不是某个人。这会消除由于人员调动到其他岗位或其他职位变动导致企业人员组织结构变化带来的混乱。
紧急情况下保持与企业正常生产时相同管理结构有很大好处，企业总负责人应该担任企业应急总指挥的职位。在一些情况下，委派更熟悉应操作的人员担任企业应急总指挥比总经理更合适。如果这样是更好的选择，他应该在计划阶段绝对明确出来，并应在应急组织结构图上表示出来。
总体上，所有应急职位特别是企业应急总指挥应该有代理人，以免企业总经理或其他领导不在现场时代替履行职责。当企业应急总指挥在紧急事故中受伤时，代理人员应该负责其职责。应该制定有关规定保证企业应急总指挥在任何时候都能履行职责，他对企业的状况必须有充分的了解。初期当班经理可能是这个位置上最好的候选人，因而常被任命为企业应急总指挥直到更高级的负责人到来，从而保证指挥岗位全天时段都有人负责。
发生特大紧急事故时，决策必定影响到整个企业甚至企业以外人员的安全和它们的财产和环境。在这种情况下，应预先明确谁有法律责任来做出这种决策。地方政府负责人有这种责任和权力，或者是地方政府应急指挥员。
企业应急总指挥的职位变动时应该及时通知所有负责各种反应功能的人和政府反应组织和部门。
在许多情况下，公安消防部门是第一个企业外应急反应者。当企业应急总指挥仍在负责现场指挥时，当地安全、公安、消防的主管或社区负责人，可以作为企业外应急指挥，甚至作为应急总指挥。
在大多数情况下，企业应急总指挥最初在控制室由操作人员帮助协调反应行动。可是，当应急升级和应急反应组织开始部署时，应急指挥中心应该转移到预先指定的应急地区，企业应急总指挥在此与他的工作人员一起工作，如果应急指挥中心直接暴露在事故危害区，企业应急总指挥应决定转移到其他安全区域。
（4）反应操作副总指挥
反应操作副总指挥在应急指挥中心操作，他负责监察和协调具有减缓事故后果功能的各种任务，反应操作副总指挥的主要职责是：
a．协助企业应急总指挥组织和指挥应急操作任务；
b．向企业应急总指挥提出应采取的减缓事故后果行动的对策和建议；
c．保持与现场操作副总指挥的直接联络；
d．协调、组织和获取应急所需的其他资源、设备以支援现场的应急操作。
完成这种功能的人员应该非常熟悉企业及其组织。通常维修或生产经理应该担当这个职责。在小企业反应操作副总指挥的功能可以和企业应急总指挥的功能合并，这两个职位都由一个人担任。当应急初始阶段所有反应组织还没有部署完成，也可以出现这种情况。
（5）事故现场副总指挥
事故现场副总指挥是在直接事故现场最高级的应急反应组织指挥。他的指挥部应该尽可能接近应急现场操作的位置，当然也要考虑到安全的因素。事故现场副总指挥的主要职责是：
a．所有事故现场操作的指挥和协调；
b．现场事故评估；
c．保证企业人员和公众的应急反应行动的执行；
d．控制紧急情况；
e．现场应急行动与在应急指挥中心的反应操作副总指挥的协调。
事故现场副总指挥必须具有丰富技术经验并熟悉企业。这个职位应由企业安全部门经理或生产经理担任。紧急初始阶段，很可能这个职位（和其他职位）都由当班经理直接担任或由地方政府应急的管理者担任。