但是，服用深海鱼油并非越多越有益，过量服用很可能产生副作用。鱼油所含不饱和脂肪酸化学结构很不稳定，容易被氧化，如果体内有过多的不饱和脂肪酸，会产生过氧化反应，从而产生一种叫做“自由基”的物质，自由基失去平衡时，会干扰人体内的正常生化过程，产生不溶性脂褐素，形成“老年斑”。老年斑不仅在皮肤上出现，也可在血管、心、肝、肾、脑等组织内累积，导致心脑血管等疾病。
况且，目前对服用深海鱼油的问题，专家们也有许多不同看法。有些权威专家认为，深海鱼和浅海鱼，甚至淡水鱼，它们的鱼油构成都是一样的，主要成分不外乎两种不饱和脂肪酸：EPA和DHA，所不同的只是深海鱼油中的含量略高。如果花大价钱买鱼油还不如吃鱼。况且，许多植物油，如花生油、芝麻油、豆油等，都含有许多不饱和脂肪酸。
对深海鱼油虽然有不同看法，不过总的来说，它的调理功能还是被大家肯定的。一般来讲，每周服用3—4次，每次服用1粒，就能满足身体的需要，没有必要多服。