烤红薯小贩用的铁桶炉大多是用废铁桶改制的，不少化工原料含有可能危害人体健康的成分，有些在高温条件下可能会慢慢挥发，黏附在烤红薯表皮上，吃这种红薯就很不卫生。
特别需要提醒喜爱吃烤红薯爱好者注意的是，小贩一般都把受了黑斑病菌污染的红薯与好红薯放在一起烤，在烤熟的红薯上，原先较明显的黑斑已很难看出。有关专家称，黑斑病菌排出的毒素中含有番薯酮和番薯酮醇，这种毒素会使生红薯变硬、发苦，用水煮、蒸或用火烤均不能杀灭，进入人体后对肝脏有害。因吃了黑斑红薯发生急性中毒的病人，会出现呕吐、腹泻等症状，严重者甚至会发高烧、气喘、抽搐。
专家建议，喜欢吃烤红薯的市民可以去超市或菜场选购新鲜干净、表皮光洁的生红薯，自己用微波炉烤，这样的烤红薯是“放心红薯”。